| Proje Ekibi |
Doç. Dr. Erdem TOKTAY
Kafkas Üniversitesi, Türkiye Projedeki Rolü: Araştırmacı |
| Proje Türü | TÜBA ve TÜBİTAK Destekli Proje |
| Proje No | - |
| Proje Konusu | HER2, östrojen ve progesteron reseptörlerinin kaybı ile karakterize olan triple-negatif meme kanseri (TNBC), oldukça agresif fenotip ve kötü prognoz gösteren meme kanseri alttipidir. İlgili hormon reseptörlerinden yoksun olduğundan dolayı, endokrinoterapi ve diğer kişiselleştirilmiş terapi seçenekleri, TNBC hastaları için sınırlıdır. Bu durum, TNBC hastalarının tedavileri için yeni ve etkili hedeflerin tanımlanması ihtiyacını doğurmaktadır. Bu nedenle sunmuş olduğumuz projede, TNBC karsinogenezinde rolü olma ihtimaline sahip ve henüz tanımlanmamış hedefleri aradık. In silico analizlerimiz sonucunda meme kanseri hastalarında Ly1 Antibody Reactive (LYAR) ekspresyon seviyesinin TNBC’nin diagnostik belirteçleri olan HER2, ESR1 ve PGR seviyeleri ile negatif bir korelasyona sahip olduğunu ve TNBC hücre hatlarındaki LYAR ekspresyonunun TNBC olmayan hücre hatlarına kıyasla upregüle olduğunu gördük. Ayrıca, Kaplan-Meier plotter platformunu kullanarak LYAR ekspresyonunun, meme kanseri hastalarının sağkalım oranları ile bir ilişkisinin olup olmadığını analiz ettik ve güçlü bir şekilde yüksek LYAR ekspresyonuna sahip hastaların düşük sağkalım oranlarına sahip olduğunu bulduk. Çinko parmak sınıfına ait transkripsiyon faktör olan LYAR, embriyonik kök hücreler ve nöroblastom hücreleri gibi çeşitli hücrelerde hücre çoğalmasını regüle edici onkogenik bir protein olarak fonksiyon göstermektedir. Meme kanseri hastalarında sıklıkla amplifiye olan global bir transkripsiyon faktör olan c-MYC gibi LYAR transkripsiyon faktörünün de rRNA gibi kodlamayan RNA’ların transkripsiyonlarına katıldığı yakın zamanlarda keşfedilmiştir. İşte, kodlayan ve kodlamayan RNA moleküllerinin transkripsiyonel regülasyonlarına katkı sağlayarak LYAR’ın, TNBC karsinogenezine ve progresyonuna katkı sağlayabileceğini hipotez ettik. Bu bağlamda önerdiğimiz projede LYAR transkripsiyon faktörünün TNBC üzerindeki etkilerini moleküler mekanizmalarıyla in vitro ve in vivo yaklaşımlarla aydınlatmayı amaçladık. Bu çalışmada, LYAR modülasyonunun TNBC hücreleri üzerindeki biyolojik etkilerini in vitro koşullarda tespit etmek için MTT, hücre döngüsü analizi, migrasyon/invazyon ve mammosphere deneylerini gerçekleştireceğiz. TNBC hücrelerinin doxorubicine karşı yanıtlarında LYAR’ın olası rolünün moleküler mekanizmalarıyla birlikte tespit etmek için TUNEL deneyleri ve ELISA-tabanlı apoptoz ilişkili protein array sistemi kullanılacaktır. Akabinde, RNA-seq and ChIP-seq yaklaşımlarıyla LYAR tarafından transkripsiyonel olarak regüle olan ve triple-negatif meme kanserinde rol oynayan kodlayan ve kodlamayan genleri tanımlamayı amaçlıyoruz. Ayrıca, LYAR overeksprese edilen veya susturulan TNBC hücre gruplarında sağkalım, proliferasyon, EMT ve invazyon süreçlerini regüle eden çeşitli onkogenlerin protein düzeyinde seviyelerini tespit etmek için Western blot analizleri kullanılacaktır. LYAR’ın TNBC’lerdeki rolünü in vivo ortamda değerlendirmek için, LYAR overeksprese edilen TNBC hücre gruplarıyla veya LYAR susturulmuş TNBC gruplarını nude farelere transplante ederek xenograft model oluşturacağız. Sonuç olarak proje önerimiz, kritik bir transkripsiyonel düzenleyici olarak LYAR'ın, TNBC'ler için in vitro ve in vivo yaklaşımlarla yeni rollerini açıklayacağını ve TNBC hastalarının tedavilerine yönelik girişimlere katkı sunacağını ve LYAR'a dayalı tedavi stratejilerine ışık tutacağına inanıyoruz. |
| Proje Durumu | Devam Ediyor |
| Başlangıç Tarihi | 01-04-2022 |
| Bitiş Tarihi |
