Computational Investigation of 5.5,7-trihydroxy-3,7-dimethoxy-4-4-O-biflavone from Flavonoids Using DFT Calculations and Molecular Docking
Yazarlar (3)
Mehmet Bağlan
Kafkas Üniversitesi, Türkiye
Doç. Dr. Ümit YILDIKO
Kafkas Üniversitesi, Türkiye
Gören Kenan
Türkiye
| Makale Türü |
Özgün Makale
(Ulusal alan endekslerinde (TR Dizin, ULAKBİM) yayınlanan tam makale)
|
||
| Dergi Adı | Adıyaman Üniversitesi Fen Bilimleri Dergisi | ||
| Dergi ISSN | 2147-1630 Scopus Dergi | ||
| Dergi Tarandığı Indeksler | TR DİZİN | ||
| Makale Dili | İngilizce | Basım Tarihi | 12-2022 |
| Cilt / Sayı / Sayfa | 12 / 2 / 283–298 | DOI | 10.37094/adyujsci.1121018 |
| Makale Linki | http://dx.doi.org/10.37094/adyujsci.1121018 | ||
| Özet |
| Bu çalışmada, 5,5'',7''-trihidroksi-3,7-dimetoksi-4'-4'''-O-biflavon (TDOB) molekülünün yapısal karakterizasyonu yapıldı. Bu molekülün yapısal karakterizasyonu için, molekülün kararlı faz geometrisine dayalı olarak, tüm hesaplamalar sırasıyla CAM-B3LYP ve PBEPBE metotlarını SDD ve LanL2DZ temel seti kullanılarak yapıldı. Çalışmamızda TDOB molekülünün HOMO-LUMO enerji boşlukları, yörüngeler arası ve yörüngeler arası bağ etkileşimleri, elektrostatik yüzey haritalama işlemleri gibi birçok hesaplamalarda yapılmıştır. Çalışmamızın devamında moleküler doking kullanılarak ligandın protein üzerindeki spesifik bağlanma yeri ve mekanizması araştırıldı. Doking çalışmasında, TDOB- aldoz reduktaz (PDB: 4ICC) ve TDOB- aldoz reduktaz (PDB: 4IGS) ile afinite skorları sırasıyla -8.559 kcal/mol ve -5.461 kcal/mol olarak bulundu. TDOB- aldoz reduktaz (PDB: 4ICC) reseptör bağlanma skoru daha büyük olduğu tespit edildi. Moleküler doking çalışmasının devamında TDOB'nin inhibitör özellikleri, her ikisi de etkili inhibisyon gösteren (PDB: 4ICC) ve (PDB: 4IGS) enzimlerine karşı araştırıldı ve TDOB molekülünün, (PDB: 4ICC) ve (PDB: 4IGS) aldoz reduktaz enzimlerini etkili bir şekilde inhibe ettiği görüldü. |
| Anahtar Kelimeler |
| Flavonoidler | TDOB | HOMO-LUMO | Moleküler doking |
BM Sürdürülebilir Kalkınma Amaçları
| Atıf Sayıları | |
| TRDizin | 8 |