img
Computational Investigation of 5.5,7-trihydroxy-3,7-dimethoxy-4-4-O-biflavone from Flavonoids Using DFT Calculations and Molecular Docking    
Yazarlar
Mehmet Bağlan
Türkiye
Doç. Dr. Ümit YILDIKO
Kafkas Üniversitesi, Türkiye
Gören Kenan
Türkiye
Özet
Bu çalışmada, 5,5'',7''-trihidroksi-3,7-dimetoksi-4'-4'''-O-biflavon (TDOB) molekülünün yapısal karakterizasyonu yapıldı. Bu molekülün yapısal karakterizasyonu için, molekülün kararlı faz geometrisine dayalı olarak, tüm hesaplamalar sırasıyla CAM-B3LYP ve PBEPBE metotlarını SDD ve LanL2DZ temel seti kullanılarak yapıldı. Çalışmamızda TDOB molekülünün HOMO-LUMO enerji boşlukları, yörüngeler arası ve yörüngeler arası bağ etkileşimleri, elektrostatik yüzey haritalama işlemleri gibi birçok hesaplamalarda yapılmıştır. Çalışmamızın devamında moleküler doking kullanılarak ligandın protein üzerindeki spesifik bağlanma yeri ve mekanizması araştırıldı. Doking çalışmasında, TDOB- aldoz reduktaz (PDB: 4ICC) ve TDOB- aldoz reduktaz (PDB: 4IGS) ile afinite skorları sırasıyla -8.559 kcal/mol ve -5.461 kcal/mol olarak bulundu. TDOB- aldoz reduktaz (PDB: 4ICC) reseptör bağlanma skoru daha büyük olduğu tespit edildi. Moleküler doking çalışmasının devamında TDOB'nin inhibitör özellikleri, her ikisi de etkili inhibisyon gösteren (PDB: 4ICC) ve (PDB: 4IGS) enzimlerine karşı araştırıldı ve TDOB molekülünün, (PDB: 4ICC) ve (PDB: 4IGS) aldoz reduktaz enzimlerini etkili bir şekilde inhibe ettiği görüldü.
Anahtar Kelimeler
Flavonoidler,TDOB,HOMO-LUMO,Moleküler doking
Makale Türü Özgün Makale
Makale Alt Türü Ulusal alan endekslerinde (TR Dizin, ULAKBİM) yayımlanan tam makale
Dergi Adı Adiyaman University
Dergi ISSN 2147-1630
Dergi Tarandığı Indeksler TR DİZİN
Makale Dili Türkçe
Basım Tarihi 12-2022
Cilt No 12
Sayı 2
Doi Numarası 10.37094/adyujsci.1121018
Makale Linki http://dx.doi.org/10.37094/adyujsci.1121018