Hepatitis C Genotype Assay and Sequence Analysis at a University Hospital in Eastern Türkiye
Yazarlar (3)
Doç. Dr. Çiğdem Eda BALKAN BOZLAK Kafkas Üniversitesi, Türkiye
Dr. Öğr. Üyesi Abdullah GÜMÜŞ Kafkas Üniversitesi, Türkiye
Ahmet Yılmaz Atatürk Üniversitesi, Türkiye
| Makale Türü |
Özgün Makale
(Ulusal alan endekslerinde (TR Dizin, ULAKBİM) yayınlanan tam makale)
|
||
| Dergi Adı | Kafkas Tıp Bilimleri Dergisi | ||
| Dergi ISSN | 2146-2631 | ||
| Dergi Tarandığı Indeksler | EBSCO, ULAKBİM | ||
| Makale Dili | İngilizce | Basım Tarihi | 12-2023 |
| Cilt / Sayı / Sayfa | 13 / 3 / 279–286 | DOI | – |
| Makale Linki | https://dergipark.org.tr/en/pub/kaftbd/issue/82580/1414580 | ||
| Özet |
| Amaç: Hepatit C virüsü (HCV), dünya çapında siroz, karaciğer yet- mezliği ve kansere neden olabilen birçok genotip ve alt tipi olan bir virüstür. HCV enfeksiyonlarının tedavi sürecini belirlemek için ülkelerin HCV genotiplerini ve alt tiplerini belirlemeleri de önemlidir. Bu çalışmada üç yıldır Kafkas Üniversitesi Hastanesi’ne gelen ve makro-ELISA’da anti-HCV pozitif bulunan 71 hastada HCV genoti- pini belirlemeyi amaçladık. Materyal ve Metot: Hastanemize başvuran ve ELISA yöntemi ile anti-HCV pozitif saptanan hastalardan alınan 71 örnek çalışmamı - za dâhil edildi. HCV genomunun 5’çevrilmemiş bölgesi (5’UTR) bölgesi, PCR ile amplifiye edildi ve sekanslandı. 5’UTR bölgesi için 5’-ctgtgaggaactactgtctt-3’ ve 5’-atactcgaggtgcacggtctacga- gacct-3’ primerleri kullanıldı. Sekans reaksiyonları, bir ABI Prism 3130xl DNA sekanslayıcı üzerinde gerçekleştirildi ve sekans analizi yapıldı. Ortaya çıkan sekans, genotipi tespit etmek için HCV Veri Bankasında tarandı. Bulgular: Elli altı örneğin HCV genotip dağılımı şu şekildeydi; Hastaların 27’si (%48) erkek, 29’u (%51) kadındı. Genotip la, altı (%8,5); Genotip 1b, kırk (%71); Genotip 3a, yedi (%12); Genotip 4, üç (%6). Türkiye’de en yaygın tür olan Type1b, sonuçlarımıza göre ilimizde de en yüksek tür olarak bulundu. Sonuç: HCV genotipini belirlemeye yönelik ilk çalışma olması ne - deniyle bölgemizin Türkiye’de HCV pozitif hastalara uygulanacak tedavilerin oluşturulmasında izlenecek prosedürlerin bölgesel da- ğılımına katkı sağlayacağını umuyoruz. |
| Anahtar Kelimeler |
| HCV | genotip | alt tipler | sekans analizi | polimeraz zincir reaksiyonu |
