img
img
Hepatitis C Genotype Assay and Sequence Analysis at a University Hospital in Eastern Türkiye    
Yazarlar (3)
Doç. Dr. Çiğdem Eda BALKAN BOZLAK Doç. Dr. Çiğdem Eda BALKAN BOZLAK
Kafkas Üniversitesi, Türkiye
Dr. Öğr. Üyesi Abdullah GÜMÜŞ Dr. Öğr. Üyesi Abdullah GÜMÜŞ
Kafkas Üniversitesi, Türkiye
Ahmet Yılmaz
Atatürk Üniversitesi, Türkiye
Devamını Göster
Özet
Amaç: Hepatit C virüsü (HCV), dünya çapında siroz, karaciğer yet- mezliği ve kansere neden olabilen birçok genotip ve alt tipi olan bir virüstür. HCV enfeksiyonlarının tedavi sürecini belirlemek için ülkelerin HCV genotiplerini ve alt tiplerini belirlemeleri de önemlidir. Bu çalışmada üç yıldır Kafkas Üniversitesi Hastanesi’ne gelen ve makro-ELISA’da anti-HCV pozitif bulunan 71 hastada HCV genoti- pini belirlemeyi amaçladık. Materyal ve Metot: Hastanemize başvuran ve ELISA yöntemi ile anti-HCV pozitif saptanan hastalardan alınan 71 örnek çalışmamı - za dâhil edildi. HCV genomunun 5’çevrilmemiş bölgesi (5’UTR) bölgesi, PCR ile amplifiye edildi ve sekanslandı. 5’UTR bölgesi için 5’-ctgtgaggaactactgtctt-3’ ve 5’-atactcgaggtgcacggtctacga- gacct-3’ primerleri kullanıldı. Sekans reaksiyonları, bir ABI Prism 3130xl DNA sekanslayıcı üzerinde gerçekleştirildi ve sekans analizi yapıldı. Ortaya çıkan sekans, genotipi tespit etmek için HCV Veri Bankasında tarandı. Bulgular: Elli altı örneğin HCV genotip dağılımı şu şekildeydi; Hastaların 27’si (%48) erkek, 29’u (%51) kadındı. Genotip la, altı (%8,5); Genotip 1b, kırk (%71); Genotip 3a, yedi (%12); Genotip 4, üç (%6). Türkiye’de en yaygın tür olan Type1b, sonuçlarımıza göre ilimizde de en yüksek tür olarak bulundu. Sonuç: HCV genotipini belirlemeye yönelik ilk çalışma olması ne - deniyle bölgemizin Türkiye’de HCV pozitif hastalara uygulanacak tedavilerin oluşturulmasında izlenecek prosedürlerin bölgesel da- ğılımına katkı sağlayacağını umuyoruz.
Anahtar Kelimeler
HCV | genotip | alt tipler | sekans analizi | polimeraz zincir reaksiyonu
Makale Türü Açık Erişim Özgün Makale
Makale Alt Türü Ulusal alan endekslerinde (TR Dizin, ULAKBİM) yayınlanan tam makale
Dergi Adı Kafkas Tıp Bilimleri Dergisi
Dergi ISSN 2146-2631
Dergi Tarandığı Indeksler TR DİZİN
Makale Dili İngilizce
Basım Tarihi 01-2023
Cilt No 13
Sayı 3
Sayfalar 279 / 286
Doi Numarası 10.5505/kjms.2023.47108
Makale Linki http://dx.doi.org/10.5505/kjms.2023.47108