img
In silico Investigation of the Interactions of Thymol and Carvacrol on the Spike Protein of Omicron Variant and MPro Enzyme of Coronavirus     
Yazarlar
Doç. Dr. Füreya Elif ÖZTÜRKKAN Doç. Dr. Füreya Elif ÖZTÜRKKAN
Kafkas Üniversitesi, Türkiye
Doç. Dr. Giray Buğra AKBABA Doç. Dr. Giray Buğra AKBABA
Kafkas Üniversitesi, Türkiye
Doç. Dr. Pınar AKSU KILIÇLE Doç. Dr. Pınar AKSU KILIÇLE
Kafkas Üniversitesi, Türkiye
Özet
Aralık 2019'dan beri dünyayı etkisi almış olan koronavirüs hastalığına karşı birçok ilaç çalışması yapılmış ve doğal tedavi yöntemleri üzerine bazı çalışmalar yapılmıştır. Kekik olarak bilinen T. vulgaris’in koronavirüs hastalığı tedavisi ile ilgili birçok öneride bulunulmuş ancak bu konu ile ilgili literatürde boşluklar bulunmaktadır. Bu çalışmada, T. vulgaris'in ana bileşenlerinin anti-şiddetli akut solunum sendromu koronavirüs 2 potansiyeli in silico olarak araştırılmıştır. Timol ve karvakrol, T. vulgaris bitkisinin uçucu yağının ana bileşenleridir. Kekik esansiyel yağının ana bileşenlerinin SARS CoV-2 ana proteaz ve Omicron varyantı Spike proteini üzerindeki etkilerini moleküler yerleştirme çalışmaları kullanılarak incelenmiştir. Ayrıca bu iki bileşiğin adsorpsiyon, dağılım, metabolizma, absorpsiyon ve toksik (ADMET) özelliklerini çevrimiçi veritabanlarının yardımıyla incelenmiştir. Timol ve karvakrol, şiddetli akut solunum sendromu koronavirüs 2'nin Omicron varyantının spike proteinine, ana proteaz enzimine kıyasla güçlü bir bağlanma afinitesine sahiptir. Bileşikler, hedef proteinler ile elektrostatik, hidrojen bağı ve hidrofobik etkileşimlerle bağlanmaktadır. Karvakrol bileşiğinin hedef proteinlerle olan etkileşimleri yapı-aktivite ilişkisi açısından değerlendirildiğinde daha umut verici bulgular göstermektedir.
Anahtar Kelimeler
Makale Türü Özgün Makale
Makale Alt Türü Ulusal alan endekslerinde (TR Dizin, ULAKBİM) yayımlanan tam makale
Dergi Adı Karadeniz Fen Bilimleri Dergisi
Dergi ISSN 2564-7377
Dergi Tarandığı Indeksler TR DİZİN
Makale Dili İngilizce
Basım Tarihi 09-2024
Cilt No 14
Sayı 3
Sayfalar 997 / 1005
Doi Numarası 10.31466/kfbd.1338012
Makale Linki http://dx.doi.org/10.31466/kfbd.1338012