img
Pirazinamid Dirençli Mycobacterium tuberculosis İzolatlarında Direnç ile İlişkili pncA, rpsA ve panD Gen Mutasyonları ve Spoligotiplerin Araştırılması    
Yazarlar
Dr. Öğr. Üyesi Didem ÖZGÜR
Kafkas Üniversitesi, Türkiye
Seda Tezcan Ülger
Mersin Üniversitesi, Türkiye
Mediha Begüm Kayar
Gaziantep İslam Bilim ve Teknoloji Üniversitesi, Türkiye
Can Biçmen
Türkiye
Ahmet Aslantürk
Türkiye
Mahmut Ülger
Mersin Üniversitesi, Türkiye
Gönül Aslan
Mersin Üniversitesi, Türkiye
Özet
Pirazinamid (PZA), tüberküloz (TB) tedavisinde kullanılan birinci seçenek anti-TB ilaçlardandır. PZA’nın
persistan haldeki basilleri ortadan kaldırarak tedavi süresini 9-12 aydan altı aya kısaltabilme yeteneği göz
önüne alındığında, tedavi rejiminin önemli bir taşını oluşturduğu görülmüştür. PZA direncine neden olan
temel mekanizma %70-97 oranında pncA mutasyonları iken, rpsA ve panD mutasyonlarının da dirence
neden olduğu tespit edilmiştir. Bu çalışmada, PZA dirençli Mycobacterium tuberculosis izolatlarında dirençle
ilişkilendirilen pncA, rpsA ve panD gen mutasyonlarını, PZA direncini belirlemede pirazinamidaz (PZAz)
enzim testinin etkinliğini, antitüberküloz ilaç duyarlılığını ve spoligotipleme yöntemi ile izolatların ait oldukları aileleri belirlemek amaçlanmıştır. Çalışmaya PZA dirençli 46 M.tuberculosis izolatı dahil edilmiştir.
PZA direnci ile ilişkilendirilen pncA, rpsA, panD mutasyonları in-house polimeraz zincir reaksiyonu (PCR)
yöntemini takiben uygulanan DNA dizilemeyle araştırılmıştır. İzolatların ilaç duyarlılıkları Bactec MGIT 960
(Becton Dickinson, ABD) sistemiyle, PZAz varlığı kolorimetrik PZAz enzim testiyle ve ailelerin belirlenmesi
spoligotiplendirme yöntemi kullanılarak belirlenmiştir. PZA dirençli 46 izolatın 24 (%52.2)’ü PZA’e tek başına dirençli, 11 (%23.9)’i çok ilaca dirençli (ÇİD)-TB ve 11 (%23.9)’i de birden çok ilaca dirençli (BÇİD)-TB
olarak tespit edilmiştir. PZA dirençli M.tuberculosis izolatlarının %73.9 (34)’unda direnç ile ilişki gen mutasyonları saptanmıştır. İzolatların %71.7(33)’sinde pncA, %28.2 (13)’sinde rpsA ve %4.3 (n= 2)’ünde panD
mutasyonları tespit edilmiştir. Mutasyon saptanan 12 izolatta pncA/rpsA gen mutasyonları ve iki izolatta
pncA/panD gen mutasyonları birlikteliği belirlenmiştir. Kolorimetrik PZAz testi ile enzim varlığı tespit edilen
9 (%19.6) izolatın 3 (%33.3)’ünde pncA gen mutasyonları gözlenmiştir. pncA geninde A226C (%27.3),
A152C (%24.2), C169G (%21.2) A422C (%9.1), G145A (%6.1), A29G (%6.1), A424G (%3) ve T464G
(%3) olmak üzere “missense” mutasyon şeklinde sekiz farklı nokta mutasyonu tespit edilmiştir. rpsA geninde en sık A636C (%42.9) sessiz mutasyonlar ve G1318A (%42.9) “missense” mutasyonlar; panD geninde
ise C66G (%50) “nonsense” ve A145G (%50) “missense” mutasyonlar saptanmıştır. PZA dirençli izolatların genotiplendirilmesi sonucunda en sık karşılaşılan genotiplerin 17 (%36.9) izolat ile T1 kümesinde yer
aldığı; bunu sırası ile 7 (%15.2) izolat ile Beijing, 6 (%13) izolat ile H3, 5 (%10.9) izolat ile TUR ve 4 (%8.7)
izolat ile LAM 9 ailelerinin takip ettiği belirlenmiştir. Ayrıca ORPHAN ailesine ait 2 (%4.3) izolat; LAM TUR,
LAM 2, LAM 7, T2, T5-RUS1 ailelerine ait birer izolat tespit edilmiştir. Çalışmamız, Türkiye’de PZA direncine
neden olduğu tespit edilmiş pncA, rpsA ve panD gen mutasyonlarının tamamının araştırıldığı ilk çalışmadır.
PZA direnci ile ilgili yapılan epidemiyolojik araştırmalar, direnç mekanizmasının aydınlatılmasına ve direncin saptanmasına yönelik hızlı tanı sağlayacak yöntemlerin geliştirilmesine önemli katkılar sağlayacaktır.
Anahtar Kelimeler
Makale Türü Özgün Makale
Makale Alt Türü SSCI, AHCI, SCI, SCI-Exp dergilerinde yayımlanan tam makale
Dergi Adı Mikrobiyoloji Bulteni
Dergi ISSN 0374-9096
Dergi Tarandığı Indeksler SCI-Expanded
Dergi Grubu Q4
Makale Dili Türkçe
Basım Tarihi 04-2022
Cilt No 56
Sayı 2
Sayfalar 191 / 205
Doi Numarası 10.5578/mb.20229801
Makale Linki http://dx.doi.org/10.5578/mb.20229801