Linkage Disequilibrium (LD) Analysis in Alfalfa (Medicago sativa L.) Populations Spreading in Different Geographies of the World
   
Yazarlar (1)
Dr. Öğr. Üyesi Doğan İLHAN Kafkas Üniversitesi, Türkiye
Makale Türü Açık Erişim Özgün Makale (Ulusal alan endekslerinde (TR Dizin, ULAKBİM) yayınlanan tam makale)
Dergi Adı Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Tarım ve Doğa Dergisi
Dergi ISSN 2619-9149 Wos Dergi
Dergi Tarandığı Indeksler TR DİZİN
Makale Dili İngilizce Basım Tarihi 01-2018
Cilt / Sayı / Sayfa 21 / 6 / 846–853 DOI 10.18016/ksutarimdoga.vi.452852
Makale Linki https://doi.org/10.18016/ksutarimdoga.vi.452852
Özet
Kültür yoncası (Medicago sativa L.), ıslah çalışmaları sonucunda Medicago sativa tür kompleksinden geliştirilmiştir. Son zamanlarda, yonca bitkisindeki çalışmaların moleküler markörler temelinde DNA polimorfizmlerini belirlemeye ve bu polimorfizmlerle ilişkili olan fenotipler arasında bağlantı kurmaya odaklandığı bilinmektedir. Özellikle genotipler ve fenotipler arasındaki ilişkiler, Bağlantı Analizleri ve İlişki Haritalama çalışmaları şeklinde değerlendirilmektedir. Bilgiler temelinde bu çalışmada; 70 populasyon için 31 SSR markörü kullanılarak Bağlantı Eşitsizliği (Linkage Disequilibrium, LD) analizi de gerçekleştirilmiştir. Bağlantı Eşitsizliği analizi için; 31 markörden 23 tanesinin yonca’nın 8 kromozomu üzerindeki fiziksel mesafeleri belirlenmiştir. 8 kromozom üzerinde 103 lokustan oluşan mesafeler Medicago truncatula genomu temel alınarak saptanmıştır. Değerlendirilen markörler için; bu populasyonlarda önemli (p<0,0001) bir Bağlantı Eşitsizliği (LD) değeri gözlenmemiştir.
Anahtar Kelimeler
Medicago sativa species complex | physical distances | SSR markers | chromosome